Dopo aver installato samba, operazione che non richiede altro che
sudo apt-get install samba

come raccomandato dagli sviluppatori è bene procedere come segue

sudo cp /etc/samba/smb.conf{,.master}

per poi apportare i cambiamenti a  /etc/samba/smb.conf.master e generare il file di configurazione con

testparm -s /etc/samba/smb.conf.master | sudo tee -a /etc/samba/smb.conf

Attivando con Nautilus (intendo clic destro su una cartella sul desktop ad esempio) la condivisione file windows in Ubuntu 9.04 (ma presumo anche nelle versioni precedenti),  non si va a modificare
/etc/samba/smb.conf
bensì nautilus crea un file con il nome della condivisione in
/var/lib/samba/usershares

Di conseguenza è meglio evitare di utilizzare la condivisione di nautilus e invece ricorrere al vecchio smb.conf, in quanto più versatile e meno problematico. Documentazione completa disponibile installando il pacchetto samba-doc con l’usuale

sudo apt-get install samba-doc